Salute e Benessere
Arima Genomics finaliza el programa de acceso temprano y lanza la plataforma Arima-HiC
Arima Genomics, Inc., una compañía de biotecnología que faculta a los investigadores para aplicar secuencias genéticas de largo alcance y estructurar información hacia la comprensión de la salud, la enfermedad y la evolución de las especies, ha anunciado hoy mismo el lanzamiento comercial completo de su tecnología Arima-HiC. El kit de preparación de muestras de Arima-HiC es un protocolo simple y rápido de 6 horas que permite la detección de interacciones de la cromatina de largo alcance que se pueden utilizar en varias aplicaciones. El lanzamiento público pone fin a un exitoso programa de acceso temprano que generó más pruebas de rendimiento del producto y comentarios valiosos de los clientes con acceso anticipado.
La escala limitada de la operación del programa de acceso temprano permitió a la compañía trabajar de manera estrecha con los clientes, lo que tuvo como consecuencia una oferta Arima-HiC optimizada. “Estamos muy contentos con el kit de Arima-HiC”,indicó Eileen Furlong PhD, Responsable de la Unidad de Biología Genómica del Laboratorio Europeo de Biología Molecular (European Molecular Biology Laboratory, EMBL).“El protocolo Arima-HiC es más rápido en término de días que nuestro protocolo de laboratorio anterior. En conjunto, mejores datos de calidad por menos esfuerzo”. En respuesta a las necesidades de los clientes de contar con estudios de baja cantidad entradas de muestras, el kit de Arima-HiC en la actualidad permite a los investigadores generar bibliotecas Hi-C de alta calidad a partir de menos de 100 000 células, según la aplicación. “Estamos encantados con la facilidad del flujo de trabajo y la calidad de datos optimizada para el análisis de bucles de cromatina y dominio topológico”, mencionó Hiruy Meharena PhD, Becario Postdoctoral del Instituto de Tecnología de Massachusetts. “El amplio respaldo para la baja cantidad de entradas es una característica significativa ya que permite a los investigadores utilizar Hi-C en muestras valiosas, por ejemplo, muestras clínicas o poblaciones de células extrañas que anteriormente se descartaban del análisis de Hi-C”.
Para facilitar el análisis de datos, la compañía colaboró con socios académicos con el fin de optimizar las herramientas de fuente abierta establecidas, incluidas HiCUP y SALSA para los datos de Arima-HiC. Estas herramientas aprovechan los aspectos singulares de los datos de Arima-HiC, por ejemplo, la gran uniformidad de cobertura y la alta relación señal a ruido de amplio alcance, para un mejor análisis de conformación de cromatina y ensamblaje de genomas. Ese compromiso con la comunidad de fuente abierta continuará siendo un enfoque clave para la compañía como parte de sus esfuerzos sostenidos para simplificar y agilizar el flujo de trabajo de la muestra a los resultados. La compañía aún continúa trabajando con colaboradores académicos fundamentales en los enfoques de Hi-C dirigidos junto con el desarrollo de flujos de trabajo para nuevas aplicaciones genómicas con el socio de la industria Agilent Technologies.
Los comentarios y datos generados por clientes de acceso temprano también desempeñan una función importante en la validación posterior de la tecnología Arima-HiC. Recientemente, se publicó el primer conjunto de datos de la Fase I del Proyecto Genoma de Vertebrados (Vertebrate Genome Project, VGP) que aprovechó la tecnología Arima-HiC. “Arima Genomics es un socio de tecnología integral del consorcio G10K y de la Fase I del proyecto VGP”, Gene Myers PhD, Miembro del consejo de G10K y Director del Instituto Max-Planck de Biología Celular Molecular y Genética, Dresde. “Arima fue seleccionada para la Fase I en función de la calidad de sus datos, demostrado a través de su capacidad para generar datos reproducibles y de alta calidad a pesar de la variabilidad de la calidad y la cantidad de las muestras de entrada. Las interacciones genómicas de amplio alcance de los datos de Arima-HiC son un componente fundamental de nuestra estrategia actual para la generación de ensamblajes de referencia para abarcar cromosomas”.
Además de los ensamblajes de genomas de alta calidad, otros laboratorios demostraron la capacidad para detectar bucles de cromatina y dominios asociados topológicamente (topologically associated domains, TAD) con amplia seguridad en la profundidad reducida significativamente de secuencias comparado con otros métodos. “La capacidad de los kits de Arima-HiC de proporcionar mayor comprensión con menos costo de secuencia será fundamental para permitir que más investigadores aprovechen la tecnología Hi-C para la comprensión de la regulación de genes dentro del contexto tridimensional del genoma”, indicó Changhoon Kim PhD, Director de Tecnología de Macrogen, Inc.
Como parte de la transición de la compañía de la salida de la fase de acceso temprano, ha ampliado sus operaciones para facilitar el acceso a la tecnología Arima-HiC a los investigadores. Además de ampliar su equipo de ventas, ha simplificado su proceso de solicitud de pedido a envío y mejorado su experiencia en soporte y servicio de atención al cliente. “El lanzamiento comercial del kit de Arima-HiC marca un hito significativo en la misión de compañía por acelerar la comprensión de la secuencia y estructura de genomas”, mencionó Siddarth Selvaraj, fundador y Director Ejecutivo de Arima Genomics.“Nuestro objetivo en esta próxima fase es permitir a los investigadores que obtengan más conocimiento del genoma al lograr que la tecnología Hi-C sea lo más accesible, asequible y fácil de usar posible”.
Acerca de Arima Genomics
Arima Genomics, Inc. es una compañía de biotecnología que tiene como objetivo acelerar la comprensión de la secuencia y estructura de los genomas y su función en la salud, enfermedad y la evolución de las especies. Para obtener información adicional, visite: www.arimagenomics.com.
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Siddarth Selvaraj, 1-505-948-3116
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